蛋白質（protein）是有機大分子，是構成細胞的基本有機物和生命活動的主要承擔者。蛋白質在催化生命體內各種反應進行、新陳代謝、抵御外來物質入侵及控制遺傳信息等方面都起著重要的作用。蛋白質的一級結構是氨基酸序列，通過鑒定氨基酸序列來匹配它的蛋白質，這是定性研究，是蛋白質組學的基礎，也是蛋白質組學的重要技術之一。

質譜一般由離子源（Ion source）、質量分析器（Mass analyzer）和離子檢測器（Detector）三部分組成。傳統(tǒng)的質譜僅用于小分子揮發(fā)物質的分析，但隨著新的離子化技術的出現(xiàn)，如基質輔助激光解析電離飛行時間質譜(MALDI-TOF)和電噴霧電離質譜(ESI-MS)等，質譜技術的出現(xiàn)為蛋白質分析提供了一種新的途徑。現(xiàn)在蛋白質組學基本研究手段是：以生物質譜技術為核心，對蛋白質進行大規(guī)模、高通量分離、鑒定和分析。

蛋白質質譜鑒定的基本原理是用蛋白酶將蛋白質消化成肽段混合物，經(jīng)MAILDI或ESI等軟電離手段將其離子化，然后通過質量分析器將具有特定質核比的肽段離子分離開來。通過實際譜圖和理論上蛋白質經(jīng)過蛋白酶消化后產生的一級質譜峰圖和二級質譜峰圖進行的比對，進行蛋白鑒定。

技術特點

• 高通量、自動化程度高、分離能力強；

• 通用性強，可分析蛋白質條帶、免疫共沉淀洗脫液、組織提取液、全細胞裂解液、亞細胞分離組分等多種形式的樣品。

應用領域介紹

• 蛋白質膠點鑒定

• 蛋白質膠條鑒定

• 蛋白翻譯后修飾位點鑒定

• 蛋白N端、C端測序